Стоящая сейчас на Большом Заяцком острове деревянная церковь в честь св. Андрея Первозванного была возведена во время второго пребывания на Соловецких островах Петра I в 1702 г. Но современные исследования показывают, что известный храм на Большом Заяцком острове был в своих основных объемах возведен царскими стрельцами в 1672–1676 гг. близ монастыря и первоначально представлял собой часовню, которая в 1691 г. была перевезена на новое место, а в 1702 г. с небольшими достройками преобразована в храм во имя св. Андрея Первозванного.